Фамилия Дойников образована от прозвища Дойник, которое восходит к глаголу «доить». Вероятно, это прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность предка (он доил коров). 

Кроме того, в переносном смысле глагол «доить» означает «извлекать из кого-либо, чего-либо какую-либо выгоду для себя». В таком случае можно предположить, что основатель рода Дойниковых был хитрым, изобретательным человеком. Дойник, со временем получил фамилию Дойников.