Фамилия Голушков в 50% случаев имеет русское происхождение, в 5% - украинское, в 10% - белорусское, в 30% приходит из языков народов России (татарского, мордовского, башкирского, бурятского и т. д.), в 5% случаев происходит из болгарского или сербского языков. В любом случае эта фамилия образована от имени, прозвища, рода занятий или места жительства дальнего предка человека по мужской линии

Фамилия Голушков относится к разряду довольно редкой в регионах России и соседних стран. В известных старых дневниках носители фамилии были известными деятелями из русского новгородского мещанства в XVIII-XIX в., имевщих значительную царскую привелегию. Первые свидетельства фамилии можно почерпнуть в указателе переписи населения Древней Руси во времена царствования Ивана Грозного. У великого князя существовал особенный список привилегированных и ярких фамилий, которые давались близким только в случае особых заслуг или награды. Поэтому сия фамилия сохранила собственное начальное обозначение и является уникальной. неповторимое обозначение и является редкой..

Фамилия Голушков, вероятно, образована от прозвища Голуш, которое восходит к словам «голь, голынь» («бедность, нищета») и «голяк («бедняк, оборвыш, неимущий»). Следовательно, прозвище Голуш могло отражать социальное положение предка.

По другой версии, прозвище Голуш связано с названием украинского блюда галушки. В этом случае такое прозвище мог получить либо любитель галушек, либо тот, кто хорошо их готовил.

Чередование звуков а/о могло возникнуть под влиянием «окающих» говоров.

Скорее всего, фамилия Голушков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -ко. Со временем, вероятно, род Голушко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Голуш, со временем получил фамилию Голушков.