1.Эта фамилия имеет украинское происхождение. В основе фамилии лежит уменьшительная форма имени или прозвища дальнего предка человека по мужской линии или, реже, по женской линии. Такие фамилии широко распространены на всей территории Украины, южной Белоруссии и казачьих областях России.

2.Основой фамилии Маковенко послужило мирское имя Маковей. Наличие второго, мирского, имени было своеобразной данью древней славянской традиции двуименности. Ее целью было сокрытие главного, церковного имени от «нечести» и «злых духов». Фамилия Маковенко, согласно одной из гипотез, имеет семинарское происхождение и образована от названия народа маккавеи, упоминаемого в Библии.

Другой вариант происхождения этой фамилии представляется более правдоподобным и связан с названием религиозного праздника Спас-Маккавей (в начале августа). Народ осмыслил «маккавеи» как «маковей», тем более что в это время веяли (очищали) маковые головки. Поэтому ребенку, родившемуся в это время, могли дать имя Маковей или Маккавей. Это были притяжательные прилагательные с суффиксами –ук/-юк, -енко, изначально указывающие на имя главы семейства. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Маковей, со временем получил фамилию Маковенко.

Практика давать ребенку в дополнение к официальному крестильному имени еще одно, некрестильное, удерживалась вплоть до XVII в. и привела к тому, что фамилии, образованные от мирских имен, составили значительную часть от общего числа славянских фамилий.